英国《自然》杂志首次公布人类蛋白质组草图(ZT)

<small>28日出版的英国新一期《自然》杂志,公布了人类蛋白质组草图绘制工作的里程碑成果:两个小组发表了对人体组织、体液和细胞所做的质谱分析,标绘了人类蛋白质组草图。

如果说基因是描述生命奥秘的图纸,蛋白质就是构成生命的具体建筑材料。在人类基因组草图完成后,科学家尚不能借此完全解释生命现象,因为有些基因信息不会真的表达为蛋白质,而人类的生、老、病、死也只有在蛋白质这个更直接的层面上才能得到解释。因此如果想要阐释人类生命活动及其病理机制的实质,必须绘制人类蛋白组。

上世纪90年代,人类基因组计划开始成形时,有科学家提出了破译人类蛋白质组的想法。其目标是将人体所有蛋白质归类并描绘出它们的特性、在细胞中所处的位置以及蛋白质之间的相互作用。中国科学家在这个工程中,主要负责人类肝脏蛋白组计划。但人类蛋白质组的规模和复杂性使此类研究困难重重。

蛋白质

编码一个蛋白质氨基酸序列的基因的DNA序列

《自然》发表人类蛋白质组草图

日前,两个国际小组在《自然》杂志上分别公布了人类蛋白质组第一张草图,这些在大部分非患病人体组织和器官中表达的精选蛋白,为更好的理解疾病状态下发生的机体变化,奠定了坚实的基础。

约翰霍普金斯大学的Akhilesh Pandey及同事识别出17,294个蛋白编码基因,并通过表达分析提供了存在受组织限制和受细胞限制的蛋白的证据。通过从注解的假基因、非编码RNA和未翻译的区域识别翻译的蛋白,他们显示了“蛋白基因组”分析的重要性。他们的数据集可在www.humanproteomemap.org这个网址获得。

德国慕尼黑工业大学的Bernhard Kuster及同事为“蛋白质组数据库”(ProteomicsDB,可在www.proteomicsdb.org/这个网址获得)中的18097个基因获得了蛋白证据,展示了这种数据的用途—— 如用于识别数百个翻译的lincRNAs和对药物敏感的标记以及用于发现mRNA和组织中的蛋白水平之间的定量关系等。

在本期《自然》的其他地方,Vivien Marx报告了第三个大型蛋白质组项目,即基于抗体的“人类蛋白图集”(Human Protein Atlas)项目。

德国慕尼黑工业大学等机构研究人员报告说,尽管人类已对基因组有所了解,但大约2万个编码基因中,哪些会指导合成蛋白质、合成哪些蛋白质都是未知数。为探明这一问题,他们从人体多个组织样本和细胞系中提取蛋白质并将它们“切”成小块,然后用质谱分析法分析出形成每个蛋白质片段所需的氨基酸序列。

肌球蛋白三维结构的飘带图,其主要由α螺旋所构成

研究人员借助计算机对这些蛋白质片段与基因组进行了大量比对工作,并据此列出一个“清单”,描绘出哪些组织中的哪些基因表达与蛋白质的形成有关。在另一项研究中,美国约翰斯•霍普金斯大学研究人员与印度等国同行也采用质谱分析法绘制出一张蛋白质组草图。

这两个团队均发现,有数百种蛋白质是由此前认为不具备相关功能的DNA片段(脱氧核糖核酸)及“假基因”形成,“假基因”是指由于发生突变,丧失原有功能的基因。此外他们还发现了一些与蛋白质产生无关的“多余”基因。

研究人员表示,绘制人类蛋白质组图谱有助于了解人体内蛋白质的出处、功能和特性,这对于生命科学、医学等领域都有重要意义。而蛋白质组学研究的关键技术包括质谱分析、X射线晶体学、核磁共振和凝胶电泳。

背景资料:蛋白质组学

蛋白质组学主要有两种方法:活体样品研究和重组蛋白合成。在第二种情形下,遗传工程方法被用来克隆待合成的DNA模板,以及把这些基因移植到宿主细胞(典型的是细菌)中,后者被培养用于大规模蛋白表达。

接着,被合成蛋白需要被从宿主细胞中提取和纯化。纯化的蛋白随后通过结晶(及X-射线晶体衍射)或核磁共振来确定其结构。

相比于基因组学,蛋白质组学是更大的挑战,因为蛋白质的三维结构对其功能至关重要。在上述步骤中维持几何形状是重要且具有挑战性的。

国际人类蛋白质组计划(HPP)是继国际人类基因组计划之后的又一项大规模的国际性科技工程。首批行动计划包括由中国科学家牵头的“人类肝脏蛋白质组计划”和美国科学家牵头的“人类血浆蛋白质组计划”。“人类肝脏蛋白质组计划”的总部设在中国首都北京,这是中国科学家第一次领导执行重大国际科技协作计划。

人类之所以在基因组计划之外还要开展蛋白质组计划,是因为人类基因组计划并不像事前所预期的那样,能够逾越蛋白质这一生物功能的执行体层次,揭示人类生、老、病、死的全部秘密。更重要的是,疾病的特征主要表现在蛋白质水平上,许多重大疾病如癌症、心血管病等是多种蛋白共同作用的结果。因此,真正从蛋白质的功能结构上阐明生命活动及其病理机制的实质,才能取得突破性的进展。

从功能基因组学的角度,人们认为每种疾病平均与10种基因相关,而每种基因又与3-10种蛋白质相关。如果以人类主要的100-150种疾病计算,人类蛋白质组中则应该有3000-15000种蛋白质具有成为药物靶标的可能。

此外,国际蛋白质组织启动计划主席萨姆•哈纳什教授说,由于蛋白质组研究将提供大量新“药靶”,许多大制药公司争先加入国际人类蛋白质组计划,希望能够抢先得到最新数据以降低研发成本。

(观察者网综合新华网、《自然》杂志等报道)</small>

黄梅涴宜副院长服务圣安宁疗养院29年退休

【美国华网胡大江报道】在芝加哥南华埠近邻的圣安宁疗养院任职副院长29年的黄梅涴宜(Ruby Wong)宣布正式退休。27日晚在芝加哥北边O`Bring餐馆举办退休餐宴。出席黄梅涴宜退休餐宴有疗养院的各级领导和同仁、家人好友、社区侨领。芝加哥华人艺术团在餐宴上为黄梅涴宜献上多首精彩歌曲和舞蹈。黄梅涴宜在致辞中表示,在她1985年来到圣安宁疗养院工作时,疗养院当时只有不超过10位华裔入住老人,而且基本上没有华裔职员。在黄梅涴宜的大力推动下,圣安宁疗养院目前已经成为芝加哥南华埠最主要的照顧行动不能自理的华裔老人的疗养院。在黄梅涴宜的大力争取下,圣安宁疗养院华裔职工大幅增加,不但为华裔侨民提供了就业的机会,而且还让许多有相当专业水准的华裔人士能够在圣安宁疗养院发挥他们的作用,大大提高了疗养院的服务质量。黄梅涴宜多年来多方联系政府部门、中国领馆和台湾方面机构、华裔社区社团组织和艺术团体每年都到疗养院来看望慰问老人,让老人能够感受到社区的关爱,能够在此安度晚年。在餐宴上各方代表纷纷对黄梅婉漪多年来在圣安宁疗养院为社区老人所做出的贡献给予了高度的赞扬。
DSC_8374黄梅涴宜(左5)与圣安宁疗养院同仁在她的退休餐宴合影
DSC_8368-001

DSC_8261-001

DSC_8268-001

DSC_8332-001

DSC_8362-001

央视播出习近平原声讲话:过去是“造不如买、买不如租”,现在要倒过来

央视5月24日《新闻联播》在4分48秒左右时,播出习近平原声讲话:中国是最大的飞机市场,过去的逻辑是“造不如买、买不如租”,现在要倒过来,要花更多资金来研发、制造自己的大飞机。但在新华社通稿中,连同关于大飞机的讲话一起被“省略”。

习近平:过去说的“造不如买、买不如租”这个逻辑,现在要倒过来

新华社通稿:习近平上海考察:当好全国改革开放排头兵
新华网上海5月24日电 中共中央总书记、国家主席、中央军委主席习近平出席亚信上海峰会后在上海考察时强调,上海作为全国最大的经济中心城市,在国家发展大局中占有重要位置,要抓住机遇,锐意进取,继续当好全国改革开放排头兵、科学发展先行者,不断提高城市核心竞争力,开创各项工作新局面。
5月23日至24日,习近平在中共中央政治局委员、上海市委书记韩正和市长杨雄陪同下,深入中国上海自由贸易试验区,深入企业、园区、科研基地,考察调研经济社会发展情况。
建设中国上海自由贸易试验区,是党中央作出的重大决策,是在新形势下推进改革开放的重大举措。习近平对办好试验区十分关注,多次作出指示和批示。23日下午,他来到试验区外高桥综合服务大厅,听取试验区总体建设推进情况汇报,同工商、海关、检验检疫等窗口工作人员交流。得知试验区成立8个月来,已聚集1.6万多家投资企业、28万从业人员,在形成更加开放透明的投资管理制度、提高贸易便利化水平、深化金融制度创新、推进政府管理改革等方面取得积极成效,初步形成30多项可复制、可推广的改革事项,习近平很高兴。他强调,上海自由贸易试验区是块大试验田,要播下良种,精心耕作,精心管护,期待有好收成,并且把培育良种的经验推广开来。习近平希望试验区按照先行先试、风险可控、分步推进、逐步完善的原则,把扩大开放同改革体制结合起来,把培育功能同政策创新结合起来,大胆闯、大胆试、自主改。要切实把制度创新作为核心任务,以形成可复制、可推广的制度成果为着力点,努力创造更加国际化、市场化、法治化的公平、统一、高效的营商环境;切实把防控风险作为重要底线,在建设全过程都掌控好风险,努力排除一切可能和潜在的风险因素;切实把企业作为重要主体,重视各类企业对制度建设的需求,鼓励企业积极参与试验区建设。
习近平考察了试验区内的国家对外文化贸易基地。这是一个融多种功能的文化产品公共服务平台,可以为各类文化企业提供进出口代理、渠道拓展、产品展示、设备租赁、商贸咨询、版权交易等专业服务。习近平察看了基地保税仓库,了解利用这一平台推动国内文化企业和文化产品走出去的情况,勉励他们为实施国家文化战略、推动文化事业和文化产业发展多作贡献。
离开上海自由贸易试验区,习近平来到中国商用飞机有限责任公司设计研发中心考察。在听取商飞公司整体情况介绍后,他进入航电实验室和综合试验大厅,察看飞机航电系统,登上C919大型客机铁鸟综合试验台了解飞机多系统验证能力,登上C919大型客机展示样机了解机舱布局,观看总装制造车间实时视频图像和多款飞机模型,同研发中心的科技人员亲切交流。习近平对商飞公司成立6年来取得的成绩特别是在科研方面取得的突破表示肯定。他指出,大型客机研发和生产制造能力是一个国家航空水平的重要标志,也是一个国家整体实力的重要标志。制造大飞机承载着几代中国人的航空梦。我们的事业刚刚起步,前面的路还很长,但时间紧迫,容不得半点懈怠,要一以贯之、锲而不舍抓下去,用前进的目标激励自己,用比较的差距鞭策自己,力争早日让我们自主研制的大型客机在蓝天上自由翱翔。
24日上午,习近平先后考察了上海联影医疗科技有限公司和上海汽车集团股份有限公司,听介绍,看产品,进车间,问市场,重点了解了企业自主创新情况。每到一处,都同员工握手问候。在联影医疗科技有限公司超导MR系统、超高分辨率PET-CT系统、数字化DR机等大型医疗设备面前,公司负责人向总书记介绍这些产品拥有完全的自主知识产权,习近平称赞他们为国争了光,要求有关方面做好政策引导、组织协调、行业管理等工作,加快现代医疗设备国产化步伐,使我们自己的先进产品能推得开、用得上、有效益,让我们的民族品牌大放光彩。
在上海汽车集团技术中心,习近平参观了汽车造型设计、样车试制和新能源联调试验。他来到荣威、MG两大自主品牌系列样车面前,询问技术性能、性价比、市场认可度,肯定他们追赶前沿的创新精神。习近平强调,汽车行业是市场很大、技术含量和管理精细化程度很高的行业,发展新能源汽车是我国从汽车大国迈向汽车强国的必由之路,要加大研发力度,认真研究市场,用好用活政策,开发适应各种需求的产品,使之成为一个强劲的增长点。
习近平指出,当今世界,科技创新已经成为提高综合国力的关键支撑,成为社会生产方式和生活方式变革进步的强大引领,谁牵住了科技创新这个牛鼻子,谁走好了科技创新这步先手棋,谁就能占领先机、赢得优势。要牢牢把握科技进步大方向,瞄准世界科技前沿领域和顶尖水平,力争在基础科技领域有大的创新,在关键核心技术领域取得大的突破。要牢牢把握产业革命大趋势,围绕产业链部署创新链,把科技创新真正落到产业发展上。要牢牢把握集聚人才大举措,加强科研院所和高等院校创新条件建设,完善知识产权运用和保护机制,让各类人才的创新智慧竞相迸发。
考察期间,习近平听取了上海市工作汇报,对上海发展变化和各项工作取得的新进展给予肯定。
习近平指出,上海一定要把培育和践行社会主义核心价值观工作做得更细、更实、更深入人心,努力在这方面走在全国前列。培育和践行社会主义核心价值观,贵在坚持知行合一、坚持行胜于言,在落细、落小、落实上下功夫。要注意把社会主义核心价值观日常化、具体化、形象化、生活化,使每个人都能感知它、领悟它,内化为精神追求,外化为实际行动,做到明大德、守公德、严私德。要面向全社会做好这项工作,特别要抓好领导干部、公众人物、青少年、先进模范等重点人群。
习近平强调,发挥上海在长三角地区合作和交流中的龙头带动作用,既是上海自身发展的需要,也是中央赋予上海的一项重要使命。要按照国家统一规划、统一部署,围绕落实全国城镇化工作会议精神、参与丝绸之路经济带和海上丝绸之路建设、推动长江经济带建设等国家战略,继续完善长三角地区合作协调机制,加强专题合作,拓展合作内容,加强区域规划衔接和前瞻性研究,努力促进长三角地区率先发展、一体化发展。
习近平指出,上海建设现代化国际大都市,要进一步提高干部队伍的知识水平和干事创业本领。上海各级干部要放眼全球、放眼全国,不断提高战略思维、战略把握、战略运作能力,谋发展、创业绩不仅争创国内一流,而且敢于到国际上去比较、去竞争。要力戒浮躁,多用一些时间静心读书、静心思考,主动加快知识更新、优化知识结构,使自己任何时候才不枯、智不竭。要进一步增强改革创新意识,敞开思想谋划新思路,放开手脚追求新突破,善于从事物的对立面、差异性、因果联系中及时发现并解决存在的各种矛盾和问题。要增强信仰力量和道德力量,正确对待权力,正确对待名利,正确对待群众,做到坚定清醒有为、为民务实清廉。

马凯、王沪宁、栗战书和中央有关部门负责同志陪同考察。